www.facebook.com/mahamudul.hasan.9619 ভ্রমন করা, লেখালেখি করা, বিজ্ঞান ওয়েবসাইট দেখা, অনেক বই ও ম্যাগাজিন পড়ি এবং ওয়েবসাইট প্রোগ্রামিং করতে খুব পছন্দ করি। বিজ্ঞানী ড. শাহ ফারুক লেখাটি Scientific Bangladesh থেকে নেওয়া – লেখক: সরোয়ার হোসেন পাঠ্য-পুস্তক ও পত্র-পত্রিকা থেকে আমরা দেশের কিছু কিছু বিজ্ঞানী সম্পর্কে অবগত আছি। উইকিপিডিয়াতে দেশের বিখ্যাত বিজ্ঞানীদের একটা লিস্ট আছে। কিন্তু ঐ লিস্টে বা পাঠ্যপুস্তকে (নতুন সংস্করন সম্পর্কে জানা নেই) দেশের সবচেয়ে সফল বিজ্ঞানীর নাম উঠে আসেনি। পত্র-পত্রিকাতেও তার সম্পর্কে তেমন ফোকাস করা হয়নি।

আমাদের জানা নামগুলো আন্তর্জাতিকভাবে তেমন পরিচিত নন এবং এদের অনেকে বাংলাদেশে জন্মগ্রহনকারী, কিন্তু কর্মক্ষেত্র হচ্ছে অন্যদেশে। অনেকে আবার প্রবাসী দেশের নাগরিকত্বও নিয়েছেন। এ রকম কিছু পরিচিত বিজ্ঞানীর নাম হচ্ছে পাটের জেনোম সিকোয়েন্সের প্রধান বিজ্ঞানী মাকসুদুল আলম (আমেরিকা), ফজলুর রহমান খান (আমেরিকা), আবেদ চৌধুরী (অস্ট্রেলিয়া) প্রমুখ। বিজ্ঞানী হিসেবে ড. জাফর ইকবাল যতটুকু না পরিচিত, তার চেয়ে উনি জনপ্রিয় লেখক, শিক্ষাবিদ ও এক্টিভিস্ট হিসেবে বেশী পরিচিত। আমি যার কথা বলতে চাচ্ছি তিনি আমাদের দেশের সন্তান এবং বাংলাদেশেই কাজ করে আন্তর্জাতিক ভাবে স্বনামধন্য হয়েছেন।

অথচ জাতি অজ্ঞাতসারে! দেশের তরুন সমাজ তাঁর সম্পর্কে অন্ধকারে! তিনি ২০০৫ সালে উন্নয়নশীল দেশের বিজ্ঞানীদের মধ্যে চিকিৎসা বিজ্ঞানে (TWAS Prize-2005) সর্বোচ্চ পুরুষ্কারে ভূষিত হয়েছেন। আন্তর্জাতিকভাবে এই স্বীকৃতি অর্জনের নেপথ্যে রয়েছে সায়েন্টিফিক জার্নালের পাবলিকেশন। তিনি এ পর্যন্ত বিশ্বমানের ১০০’র উপরে পিয়ার রিভিউ গবেষনাপত্র প্রকাশ করেছেন। তার গবেষনার মান পৃথিবীর ঐ সমস্ত বিখ্যাত বিশ্ববিদ্যালয় (যেমন হার্ভার্ড, কেমব্রীজ) বা গবেষণা প্রতিষ্ঠানের (NIH) কর্মরত বিখ্যাত বিজ্ঞানীদের সাথে তুলনীয়। সম্প্রতি (২০১০) তার গবেষনালব্ধ তথ্য বিশ্বের সবচেয়ে নামকরা সায়েন্টিক জার্নাল নেচার (Nature)-এ প্রকাশিত হয়েছে, যেটা হয়ত অনেকে ব্লগের মাধ্যমে জেনেছেন।

কিন্ত পত্র-পত্রিকাতে তেমন গুরুত্ব পায়নি। ছবি- কলেরা জীবানু (Vibrio cholerae) কলেরা জীবানু নিয়ে নেচারে ঐ পাবলিকেশনের আগেই তিনি অনেকগুলো যুগান্তকারী আবিষ্কার করেছেন। এগুলোর কমপক্ষে ১৩ টি বিখ্যাত জার্নাল PNAS–এ প্রকাশিত হয়েছে, যা নামীদামী প্রতিষ্ঠানে কর্মরত অনেক বিজ্ঞানীর স্বপ্ন। গবেষনাপত্রের অনেকগুলো প্রকাশিত হয়েছে বিশ্বনন্দিত ASM Journal গুলোতে। তিনি কলেরা জীবানুর উপর প্রকাশিত বইয়ের সংকলনে এডিটর হয়েছেন।

প্রসঙ্গগত, সায়েন্টিক জার্নালের মান নির্নয়ের মাপকাঠি হচ্ছে ইম্পেক্ট ফ্যাক্টর (Impact factor)। এর উপর ভিত্তি করে বলার যায় প্রকাশিত গবেষনারলব্ধ তথ্যের মান ও কার্যকারিতা। সাধারনত ইম্পেক্ট ফ্যাক্টর যতবেশী হয়, সে জার্নাল ততবেশী মানসম্পন্ন। কিছু কিছু ক্ষেত্রে এর ব্যাতিক্রম রয়েছে। যেমন Lancet জার্নালের ইম্পেক্ট ফ্যাক্টর Nature-এর চেয়ে বেশী হলেও নেচার জার্নাল বিজ্ঞানী মহলে সবচেয়ে সন্মানীয়।

আবার কিছু জার্নালের মান (সাধারনত কোন নির্দিষ্ট রিসার্চকে ফোকাস করে, যেমন Journal of Virology, Impact factor 5.2) শুধু ইম্পেক্ট ফ্যাক্টর দিয়েও সহজে মূল্যায়ন করা যায় না। আমার জানা মতে বাংলাদেশে থেকে প্রকাশিত জার্নালের কোন ইম্পেক্ট ফ্যাক্টর নেই। এক নজরে বিশ্ববিখ্যাত জার্নালে তাঁর প্রকাশিত কিছু গবেষনাপত্র ১। Nature (Impact factor 31.4)- ১ টি ২। Lancet (Impact factor 33.6)- ৩ টি ৩।

PNAS (Impact factor 9.7)- ১৩ টি ৪। Journal of Clinical Microbiology (Impact factor 4.2)- ১৯ টি ৫। Infection and Immunity (Impact factor 4.2)- ১১ টি ৬। Book- Vibrio cholerae: Genomics and Molecular Biology, Editors: Faruque SM, Nair GB. 2008. Horizon Scientific Press, Ltd. UK কে এই বাংলাদেশে কর্মরত রহস্যময় (!) বাংলাদেশী বিজ্ঞানী? তিনি হচ্ছেন ঢাকার মহাখালিতে অবস্থিত আইসিডিডিআরবি (ICDDRB) তে কর্মরত বিজ্ঞানী ড. শাহ ফারুক (জার্নালে FARUQUE, SM নামে পরিচিত)। তিনি ১৯৭৮ ও ১৯৭৯ ঢাকা বিশ্ববিদ্যালয়ের প্রাণরসায়ন বিভাগ থেকে যথাক্রমে অনার্স ও মাস্টার্স করেন।

ড. ফারুক ইংল্যান্ডের রিডিং বিশ্ববিদ্যালয় থেকে ১৯৮৮ সালে পিএইচডি লাভ করে ঢাকা বিশ্ববিদ্যালয়ের প্রাণ রসায়ন বিভাগে শিক্ষক হিসেবে যোগ দেন। ১৯৮৯ সালে তিনি আইসিডিডিআরবি-তে সায়েন্টিস্ট হিসেবে যোগদান করেন। ড. ফারুক এর ল্যা ড. ফারুক এর ল্যাবের বিশেষত্ব হচ্ছে বাংলাদেশের তরুণ বিশ্ববিদ্যালয় গ্রাজুয়েটরা কাজ করেন এবং তাঁর প্রকাশিত জার্নালগুলোতে তাদের অবদান রয়েছে। এক কথায় বলা যায় ‘মেইড ইন বাংলাদেশ’। সায়েন্টিফিক জার্নালে গবেষনাপত্র রিভিউ করা বিজ্ঞানীদের অত্যন্ত সন্মানকজক ব্যাপার।

ড. ফারুক বর্তমানে অনেক বিখ্যাত জার্নালে রিভিউয়ার প্যানেলে আছেন, যেমন Nature, PNAS, Journal of Infectious Disease, Infection and Immunity, Journal of Bacteriology Journal of Clinical Microbiology, Journal of Medical Microbiology, Applied Environmental Microbiology. দেশের জনপ্রিয় মিডিয়াতে চোখে বুলাতেই হতাশায় বুক ভারী হয়ে যায়। হতাশাব্যঞ্জক খবরগুলো শিরোনাম দখল করে। মিডিয়ার কল্যানে অতি তুচ্ছ খবরও রাস্তা-ঘাটে, চায়ের কাপে ঝড় তোলে। কিন্তু আমাদের দেশে এত বড় আন্তর্জাতিক মানের বিজ্ঞানী অন্ধকারেই রয়ে গেছেন! তরুণদের তাকে চেনা দরকার। তাঁর অবদান স্কুলের বই-পুস্তকে থাকার যথেষ্ট দাবী রাখে।

ড. ফারুক আমাদের তরুণ সমাজের জন্য অনুপ্রেরণার উৎস ও একজন জীবন্ত উদাহরন। ড. ফারুকের প্রকাশিত গবেষণাপত্রের লিস্ট Peer Reviewed Publications Original Research Papers 1. Hassan, F., Kamruzzaman, M., Mekalanos, JJ, and Faruque, SM. Satellite phage TLCφ enables toxigenic conversion by CTX phage through dif site alteration. Nature 2010 (in press) 2. Kamruzzaman M, Udden SM, Cameron DE, Calderwood SB, Nair GB, Mekalanos JJ, Faruque SM. Quorum-regulated biofilms enhance the development of conditionally viable, environmental Vibrio cholerae. Proc. Natl. Acad. Sci. U S A. (PNAS) 107:1588-93. 2010. 3. Zahid MS, Waise TM, Kamruzzaman M, Ghosh AN, Nair GB, Mekalanos JJ, Faruque SM. The cyclic AMP (cAMP)-cAMP receptor protein signaling system mediates resistance of vibrio cholerae O1 strains to multiple environmental bacteriophages. Appl Environ Microbiol. 2010; 76:4233-4240. 4. Chowdhury N, Asakura M, Neogi SB, Hinenoya A, Haldar S, Ramamurthy T, Sarkar BL, Faruque SM, Yamasaki S. Development of simple and rapid PCR-fingerprinting methods for Vibrio cholerae on the basis of genetic diversity of the superintegron. J Appl. Microbiol. 2010 [Epub ahead of print] 5. Siddique AK, Nair GB, Alam M, Sack DA, Huq A, Nizam A, Longini IM, Qadri F, Faruque SM, Colwell RR, Ahmed S, Iqbal A, Bhuiyan NA, Sack RB. El Tor cholera with severe disease: a new threat to Asia and beyond. Epidemiol. Infect. 14:1-6, 2009 6. Hinenoya A, Naigita A, Ninomiya K, Asakura M, Shima K, Seto K, Tsukamoto T, Ramamurthy T, Faruque SM, Yamasaki S. Prevalence and characteristics of cytolethal distending toxin-producing Escherichia coli from children with diarrhea in Japan. Microbiol Immunol. 53:206-15, 2009. 7. Udden SMN, Zahid MSH, Biswas K, Ahmad QS, Cravioto A, Nair GB, Mekalanos JJ, Faruque SM. Acquisition of classical CTX prophage from Vibrio cholerae O141 by El Tor strains aided by lytic phages and chitin-induced competence. Proc. Natl. Acad. Sci USA (PNAS) 23:11951-11958. 2008 8. Zahid MS, Udden SM, Faruque AS, Calderwood SB, Mekalanos JJ, Faruque SM. Effect of phage on the infectivity of Vibrio cholerae and emergence of genetic variants. Infect Immun. 76:5266-73, 2008. 9. Rahman MH, Biwas K, Hossain MA, Sack RB, Mekalanos JJ, Faruque SM. Distribution of Genes for Virulence and Ecological Fitness among Diverse Vibrio cholerae Population in a Cholera Endemic Area: Tracking the Evolution of Pathogenic Strains. DNA & Cell Biol. 27:347-355. 2008. 10. Faruque SM, Tam VC, Chowdhury N, Diraphat P, Dziejman M, Heidelberg JF, Clemens JD, Mekalanos JJ, Nair GB. Genomic Analysis of the Mozambique Strain of Vibrio cholerae O1 reveals the origin of El Tor strains carrying classical CTX prophage. Proc Natl Acad Sci USA. (PNAS) 104:5151-5156. 2007. 11. Asakura, M., Hinenoya, A., Alam, M.S., Shima, K., Zahid, S.H., Shi, L., Sugimoto, N., Ghosh, A.N., Ramamurthy, T., Faruque, S.M., Nair G.B., and Yamasaki, S. An inducible lambdoid prophage encoding cytolethal distending toxin (Cdt-I) and a type III effector protein in enteropathogenic Escherichia coli. Proc.Natl. Acad. Sci. USA. (PNAS) 104:14483-14488. 2007. 12. Qadri F, Chowdhury MI, Faruque SM, Salam MA, Ahmed T, Begum YA, Saha A, Al Tarique A, Seidlein LV, Park E, Killeen KP, Mekalanos JJ, Clemens JD, Sack DA; the PXV Study Group. Peru-15, a live attenuated oral cholera vaccine, is safe and immunogenic in Bangladeshi toddlers and infants. Vaccine. 25:231-238. 2007 13. Faruque SM, Biswas K, Udden SM, Ahmad QS, Sack DA, Nair GB, Mekalanos JJ Transmissibility of cholera: in vivo-formed biofilms and their relationship to infectivity and persistence in the environment. Proc. Natl. Acad. Sci. U S A. (PNAS) 2006; 103:6350-6355. 14. Faruque SM, Islam MJ, Ahmad QS, Biswas K, Faruque AS, Nair GB, Sack RB, Sack DA, Mekalanos JJ. An improved technique for isolation of environmental Vibrio cholerae with epidemic potential: monitoring the emergence of a multiple-antibiotic-resistant epidemic strain in Bangladesh. J. Infect. Dis. 2006;193:1029-1036. 15. Jensen MA, Faruque SM, Mekalanos JJ, Levin BR. Modeling the role of bacteriophage in the control of cholera outbreaks Proc. Natl. Acad. Sci. USA. (PNAS) 2006; 103:4652-4657. 16. Butler SM, Nelson EJ, Chowdhury N, Faruque SM, Calderwood SB, Camilli A. Cholera stool bacteria repress chemotaxis to increase infectivity. Mol. Microbiol. 2006; 60:417-426. 17. Hasan, KZ, Pathela, P, Alam, K, Podder, G, Faruque, SM, Roy, E, Haque, AK, Haque, R, Albert, MJ, Siddique, AK, Sack, RB. Aetiology of diarrhoea in a birth cohort of children aged 0-2 year(s) in rural Mirzapur, Bangladesh. J. Health Popul. Nutr. 2006; 24:25-35. 18. Nair G.B., Qadri, F., Holmgren, J., Svennerholm, AM, Safa, A., Bhuiyan, N.A., Ahmad, Q.S., Faruque, S.M., Faruque, A.S.G., Takeda, Y., and Sack, D.A. 2006. Cholera Due to Altered El Tor Strains of Vibrio cholerae O1 in Bangladesh. J. Clin. Microbiol. 44, 4211-4213. 19. Alam M, Nur-A-Hasan, Ahsan S, Pazhani GP, Tamura K, Ramamurthy T, Gomes DJ, Rahman SR, Islam A, Akhtar F, Shinoda S, Watanabe H, Faruque SM, Nair GB. Phenotypic and Molecular Characteristics of Escherichia coli Isolated from Aquatic Environment of Bangladesh. Microbiol. Immunol. 2006;50:359-370 20. Faruque SM, Islam MJ, Ahmad QS, Faruque AS, Sack DA, Nair GB, Mekalanos JJ. Self-limiting nature of seasonal cholera epidemics: Role of host-mediated amplification of phage. Proc. Natl. Acad. Sci. U S A (PNAS). 2005.102:6119-6124. 21. Faruque, S. M., Naser I. B., Fujihara, K., Diraphat, P., Chowdhury, N., Kamruzzaman, M., Qadri, F., Yamasaki, S., Ghosh, A. N. and Mekalanos, J. J. Genomic sequence and receptor for the Vibrio cholerae phage KSF-1Φ: Evolutionary divergence among filamentous vibriophages mediating lateral gene transfer. J. Bacteriol. 2005; 187: 4095-4103, 22. Faruque SM, Naser IB, Islam MJ, Faruque AS, Ghosh AN, Nair GB, Sack DA, Mekalanos JJ. Seasonal epidemics of cholera inversely correlate with the prevalence of environmental cholera phages. Proc Natl Acad Sci U S A (PNAS). 2005; 102:1702-1707. 23. Dziejman M, Serruto D, Tam VC, Sturtevant D, Diraphat P, Faruque SM, Rahman MH, Heidelberg JF, Decker J, Li L, Montgomery KT, Grills G, Kucherlapati R, Mekalanos JJ. Genomic characterization of non-O1, non-O139 Vibrio cholerae reveals genes for a type III secretion system. Proc. Natl. Acad. Sci. U S A. (PNAS) 2005;102:3465-70. 24. Qadri F, Svennerholm AM, Shamsuzzaman S, Bhuiyan TR, Harris JB, Ghosh AN, Nair GB, Weintraub A, Faruque SM, Ryan ET, Sack DA, Calderwood SB. Reduction in capsular content and enhanced bacterial susceptibility to serum killing of Vibrio cholerae O139 associated with the 2002 cholera epidemic in Bangladesh. Infect. Immun. 2005. 73:6577-83. 25. Larocque RC, Harris JB, Dziejman M, Li X, Khan AI, Faruque AS, Faruque SM, Nair GB, Ryan ET, Qadri F, Mekalanos JJ, Calderwood SB. Transcriptional profiling of Vibrio cholerae recovered directly from patient specimens during early and late stages of human infection. Infect. Immun. 2005. 73: 4488-93. 26. Qadri F, Chowdhury MI, Faruque SM, Salam MA, Ahmed T, Begum YA, Saha A, Alam MS, Zaman K, Seidlein LV, Park E, Killeen KP, Mekalanos JJ, Clemens JD, Sack DA; Peru-15 Study Group. Randomized, controlled study of the safety and immunogenicity of Peru-15, a live attenuated oral vaccine candidate for cholera, in adult volunteers in Bangladesh. J. Infect. Dis. 2005. 192:573-9. 27. Faruque SM, Chowdhury N, Kamruzzaman M, Dziejman M, Rahman MH, Sack, DA, Nair GB, Mekalanos JJ. Genetic diversity and virulence potential of environmental Vibrio cholerae population in a cholera-endemic area. Proc. Natl. Acad Sci., USA (PNAS). 2004; 101:2123-2128. 28. Nusrin S, Khan GY, Bhuiyan NA, Ansaruzzaman M, Hossain MA, Safa A, Khan R, Faruque SM, Sack DA, Hamabata T, Takeda Y, Nair GB. Diverse CTX phages among toxigenic Vibrio cholerae O1 and O139 strains isolated between 1994 and 2002 in an area where cholera is endemic in Bangladesh. J. Clin. Microbiol. 2004; 12:5854-6. 29. De K, Ramamurthy T, Faruque SM, Yamasaki S, Takeda Y, Nair GB, Nandy RK. Molecular characterisation of rough strains of Vibrio cholerae isolated from diarrhoeal cases in India and their comparison to smooth strains. FEMS Microbiol. Lett. 2004; 232: 23-30. 30. Faruque SM, Chowdhury N, Kamruzzaman M, Ahmad QS, Faruque AS, Salam MA, Ramamurthy T, Nair GB, Weintraub A, Sack DA. Reemergence of epidemic Vibrio cholerae O139, Bangladesh. Emerg. Infect. Dis. 2003; 9:1116-1122. 31. Faruque SM, Zhu J, Kamruzzaman M., Asadulghani, Mekalanos JJ. Examination of diverse TCP positive Vibrio cholerae strains fails to demonstrate evidence for the VPI phage. Infect. Immun. 2003; 71: 2993-2999. 32. Faruque SM, Kamruzzaman M., Asadulghani, Sack DA, Mekalanos JJ, Nair GB. CTX phage-Independent Production of RS1 Satellite Phage by Vibrio cholerae. Proc. Natl. Acad. Sci., USA (PNAS). 2003; 100:1280-1285. 33. Faruque SM, Kamruzzaman M, Meraj, IM, Chowdhury, N, Nair, GB, Sack, RB, Colwell RR, Sack, DA. Pathogenic Potential of Environmental Vibrio cholerae Strains Carrying Genetic Variants of the Toxin-Coregulated Pilus Pathogenicity Island. Infect. Immun. 2003; 71:1020-5. 34. Faruque SM, Chowdhury N, Khan R, Hasan MR, Nahar J, Islam MJ, Yamasaki S, Ghosh AN, Nair GB, Sack DA. Shigella dysenteriae Type 1-specific bacteriophage from environmental waters in Bangladesh. Appl. Env. Microbiol. 2003; 69: 7028-7031. 35. Chakraborty S, Khan A, Kahili S, Faruque SM, Yamasaki S, Ramamurthy T. Infantile diarrhoea associated with sorbitol-fermenting, non-shiga toxin-producing Escherichia coli O157:H-. Eur. J. Clin. Microbiol. Infect. Dis. 2003; 22:324-326. 36. Bina J, Zhu J, Dziejman M, Faruque SM, Calderwood S, Mekalanos J. ToxR regulon of Vibrio cholerae and its expression in vibrios shed by cholera patients. Proc. Natl. Acad. Sci. USA (PNAS) 2003; 100:2801-6. 37. Sack RB, Siddique AK, Longini IM Jr, Nizam A, Yunus M, Islam MS, Morris JG Jr, Ali A, Huq A, Nair GB, Qadri F, Faruque SM, Sack DA, Colwell RR. A 4-year study of the epidemiology of Vibrio cholerae in four rural areas of Bangladesh. J. Infect. Dis. 2003; 187:96-101. 38. Faruque SM, Asadulghani, Kamruzzaman M., Nandi RK, Ghosh AN, Nair GB, Mekalanos JJ, Sack DA. RS1 element of Vibrio cholerae can propagate horizontally as a filamentous phage exploiting the morphogenesis genes of CTXΦ. Infect. Immun. 2002; 70:163-170. 39. Faruque SM, Khan R, Kamruzzaman M, Yamasaki S, ahmad QS, Azim T, Nair GB, Takeda Y, Sack DA. Isolation of Shigella dysenteriae type 1 and S. flexneri strains from surface waters in Bangladesh: comparative molecular analysis of environmental Shigella isolates versus clinical strains. Appl. Environ. Microbiol. 2002; 68:3908-3913. 40. Faruque SM, Rahman MM, Hasan AK, Nair GB, Mekalanos JJ, Sack DA. Diminished Diarrheal Response to Vibrio cholerae Strains Carrying the Replicative Form of the CTXΦ Genome instead of CTXΦ Lysogens in Adult Rabbits. Infect. Immun. 2001; 69:6084-90. 41. Faruque SM, Saha MN, Asadulghani, Sack DA, Sack RB, Takeda Y, Nair GB. The O139 serogroup of Vibrio cholerae comprises diverse clones of epidemic and nonepidemic strains derived from multiple V. cholerae O1 and non-O1 progenitors. J. Infect. Dis. 2000; 182:1161-1168. 42. Faruque SM, Asadulghani, Rahman MM, Waldor MK, Sack DA. Sunlight-induced propagation of the lysogenic phage encoding cholera toxin. Infect. Immun. 2000; 68: 4795-4801. 43. Faruque SM, Saha MN, Asadulghani, Bag PK, Bhadra RK, Bhattacharya SK, Sack RB, Takeda Y, Nair GB. Genomic diversity among Vibrio cholerae O139 strains isolated in Bangladesh and India between 1992 and 1998. FEMS Microbiol. Lett. 2000; 184:279-284. 44. Faruque SM, Rahman MM, Asadulghani, Islam KMN, Mekalanos JJ. Lysogenic conversion of environmental Vibrio mimicus strains by CTXΦ. Infect. Immun. 1999; 67:5723-5729. 45. Faruque SM, Siddique AK, Saha MN, Asadulghani, Rahman MM, Zaman K, Albert MJ, Sack DA, Sack RB. Molecular characterization of a new ribotype of Vibrio cholerae O139 Bengal associated with an outbreak of cholera in Bangladesh. J. Clin. Microbiol. 1999; 37: 1313-1318. 46. Faruque SM, Asadulghani, Saha MN, Alim ARMA, Albert MJ, Islam KMN, Mekalanos JJ. Analysis of environmental and clinical strains of nontoxigenic Vibrio cholerae for susceptibility to CTXΦ: molecular basis for the origination of new strains with epidemic potential. Infect. Immun. 1998; 66: 5819-5825 47. Faruque SM, Asadulghani, Alim ARMA, Islam KMN, Albert MJ, Mekalanos JJ. Induction of the lysogenic phage encoding cholera toxin in naturally occurring strains of toxigenic Vibrio cholerae O1 and O139. Infect. Immun. 1998; 66:3752-3757. 48. Faruque SM, Ahmed KM, Siddique AK, Zaman K, Alim ARMA, Albert MJ. 1997. Molecular analysis of toxigenic Vibrio cholerae O139 Bengal isolated in Bangladesh between 1993 and 1996: evidence for the emergence of a new clone of the Bengal vibrios. J. Clin. Microbiol. 1997; 35:2299-2306. 49. Faruque SM, Ahmed KM, Alim ARMA, Qadri F, Siddique AK, Albert MJ. Emergence of a new clone of toxigenic Vibrio cholerae biotype El Tor displacing V. cholerae O139 Bengal in Bangladesh. J. Clin. Microbiol. 1997; 35:624-630. 50. Faruque SM, Roy SK, Alim ARMA, Alber MJ. Molecular epidemiology of toxigenic Vibrio cholerae in Bangladesh studied by numerical analysis of rRNA gene restriction patterns. J. Clin. Microbiol. 1995; 33: 2833-2838. 51. Faruque SM, Alim ARMA, Roy SK, Khan F, Nair GB, Sack RB, Albert MJ. Molecular analysis of rRNA and cholera toxin genes carried by the new epidemic strain of toxigenic Vibrio cholerae O139 synonym Bengal. J. Clin. Microbiol. 1994; 32:1050-1053. 52. Faruque SM, Comstock L, Kaper JB, Albert MJ. Distribution of Zonula Occludens toxin (zot) gene among clinical isolates of Vibrio cholerae O1 in Bangladesh and Africa. J. Diarrhoeal Dis. Res. 1994;12:222-224. 53. Faruque SM, Alim ARMA, Rahman MM, Siddique AK, Sack RB, Albert MJ. Clonal relationships among classical Vibrio cholerae 01 strains isolated between 1961 and 1992 in Bangladesh. J. Clin. Microbiol 1993; 31:2513-2516. 54. Faruque SM, Rahman MM, Alim ARMA, Hoq MM, Albert MJ. Antibiotic resistance pattern of heat-labile enterotoxin (LT) producing Escherichia coli isolated from children with diarrhoea in Bangladesh: Clonal relationships among isolates with different resistance phenotypes. J. Diarrhoeal Dis. Res. 1993; 11:143-147. 55. Faruque SM, Haider K, Rahman MM, Alim ARMA, Ahmad QS, Albert MJ, Sack RB. Differentiatin of Shigella flexneri strains by rRNA gene restriction patterns. J. Clin. Microbiol. 1992; 30:2996-2999. 56. Faruque SM, Haider K, Albert MJ, Ahmad QS, Nahar S, Tzipori S. A comparative study of specific gene probes and standard bioassays to identify diarrhoeagenic Escherichia coli in paediatric patients with diarrhoea in Bangladesh. J. Med. Microbiol 1992; 36:37-40. 57. Faruque SM, Albert MJ. Genetic relation between Vibrio cholerae 01 strains in Ecuador and Bangladesh. Lancet.1992; 339:740-741. 58. Faruque SM, Haider K, Rahman MM, Alim ARMA, Baqui AH, Ahmad QS, Hossaim KMB, Albert MJ. Evaluation of a DNA probe to identify enteroaggregative Escherichia coli from children with diarrhoea in Bangladesh. J. Diarrhoeal Dis. Res. 1992; 10:31-34. 59. Nair GB, Faruque SM, Bhuiyan NA, Kamruzzaman M, Siddique AK, Sack DA. New variants of Vibrio cholerae O1 biotype El Tor with attributes of the classical biotype from hospitalized patients with acute diarrhea in Bangladesh. J. Clin. Microbiol. 2002.; 40:3296-3299. 60. Karasawa T, Ito H, Tsukomoto T, Yamasaki S, Kurazano H, Faruque SM, Nair GB, Nishibuchi M, Takeda Y. Cloning and characterization of genes encoding homologues of B subunit of cholera toxin and the Escherichia coli heat-labile enterotoxin from clinical isolates of Citrobacter freundii and E. coli. Infect. Immun. 2002; 70: 7153-7155 61. Bhuiyan NA, Ansaruzzaman M, Kamruzzaman M, Alam K, Chowdhury NR, Nishibuchi M, Faruque SM, Sack DA, Takeda Y, Nair GB. Prevalence of the pandemic genotype of Vibrio parahaemolyticus in Dhaka, Bangladesh, and significance of its distribution across different serotypes. J. Clin. Microbiol. 2002; 40 :284-6. 62. Sinha S, Chowdhury P, Chowdhury NR, Kamruzzaman M, Faruque SM, Ramamurthy T, Bhattacharya SK, Yamasaki S, Takeda Y, Nair GB. Molecular comparison of toxigenic clinical & non-toxigenic environmental strains of Vibrio cholerae O1 Ogawa isolated during an outbreak of cholera in south India. Indian J. Med. Res. 2001; 114:83-9. 63. Hochhut B, Lotfi Y, Mazel D, Faruque SM, Woodgate R, Waldor MK. Molecular analysis of antibiotic resistance gene clusters in vibrio cholerae O139 and O1 SXT constins. Antimicrob. Agents. Chemother. 2001; 45: 2991-3000. 64. Chowdhury HR, Yunus M, Zaman K, Rahman A, Faruque SM, Lescano AG, Sack RB. The efficacy of bismuth subsalicylate in the treatment of acute diarrhoea and the prevention of persistent diarrhoea. Acta. Paediatr. 2001; 90:605-10. 65. Ryan ET, Bridges EA, Crean TI, Gausia K, Hamadani JD, Aziz A, Hawkes S, Begum M, Bogaerts J, Faruque SM, Salam MA, Fuchs GJ, Calderwood SB. Local production of anti-Vibrio cholerae mucosal antibody in reproductive tract tissues after cholera. J. Infect. Dis. 2001; 184:643-7. 66. Azim T., Islam LN, Sarker MS, Ahmad SM, Hamdani JD, Faruque SM, Salam MA. Immune response of Bangladeshi children with acute diarrhea who subsequently have persistent diarrhea. J. Pediatr. Gastroenterol. Nutr. 2000; 31:528-535. 67. Casswall, TH, Sarker SA, Faruque SM, Weintraub A, Albert MJ, Fuchs GJ, Alam NH, Dahlstrom AK, Link H, Brussow H, and Hammarstrom L. Treatment of enterotoxigenic and enteropathogenic Escherichia coli-induced diarrhoea in children with bovine immunoglobulin milk concentrate from hyperimmunized cows: A double-blind, placebo-controlled trial. Scand J Gastroenterol 2000; 35:711-718. 68. Chakraborty S., Mukhopadhyay AK, Bhadra RK, Ghosh AN, Mitra R, Shimada T., Yamasaki S, Faruque SM, Takeda Y, Colwell RR, and Nair GB. Virulence genes in environmental strains of Vibrio cholerae. Appl. Env. Microbiol. 2000; 66:4022-4028. 69. Bardhan PK, Albert MJ, Alam NH, Faruque SM, Neogi PKB, Mahalanabis D. Small bowel and fecal microbiology in children suffering from persistent diarrhea in Bangladesh. J. Pediatr. Gastroenterol. Nutr. 1998; 26: 9-15. 70. Albert MJ, Faruque ASG, Faruque SM, Sack RB, Mahalanabis D. Case-control study of enteropathogens associated with childhood diarrhea in Dhaka, Bangladesh. J. Clin. Microbiol. 1999; 37:3458-3464. 71. Albert MJ, Bhuyan NA, Talukder KA, Faruque ASG, Nahar S, Faruque SM, Ansaruzzaman M Rahman M. Phenotypic and genotypic changes in Vibrio cholerae O139 Bengal. J. Clin. Microbiol. 1997; 35:2588-2592. 72. Faruque ASG, Salam MA, Faruque SM, Fuchs GJ. Etiological, clinical, and epidemiological characteristics of a seasonal peak of diarrhoea in Dhaka, Bangladesh. Scan. J. Infect. Dis. 1998; 30:393-396 73. Albert MJ, Faruque SM, Faruque ASG, Bettelheim KA, Neogi PKB, Bhuiyan NA, Kaper JB. Controlled study of cytolethal distending toxin-producing Escherichia coli infections in Bangladeshi children. J. Clin. Microbiol. 1996; 34:717-719. 74. Unicomb LE, Faruque SM, Malek MA, Faruque ASG, Albert MJ. Demonstration of a lack of synergistic effect of rotavirus with other diarrheal pathogen on severity of diarrhea in children. J. Clin. Microbiol. 1996; 34:1340-1342 75. Ansaruzzaman M, Albert MJ, Kuhn I, Faruque SM, Siddique AK, Molby R. Differentiation of Vibrio cholerae O1 isolates with biochemical fingerprinting and comparison with ribotyping. J. Diarrheal Dis. Res. 1996; 14:248-254. 76. Qadri F, Mohi MG, Azim T, Faruque SM, Kabir AKMI, Albert MJ. Production, characterization and immunodiagnostic application of a monoclonal antibody to shiga toxin. J. Diarrhoeal Dis. Res. 1996; 14:95-100. 77. Mahalanabis D, Faruque ASG, Hoque SS, Faruque SM. Hypotonic oral rehydration solution in acute diarrhoea: a controlled clinical trial. Acta. Paediatr. 1995; 84:289-293. 78. Albert MJ, Faruque SM, Faruque ASG, Neogi PKB, Ansaruzzaman M, Bhuyan NA, Alam K, Akbar MS. A controlled study of Escherichia coli diarrheal infections in Bangladeshi children. J. Clin. Microbiol. 1995; 33:973-977. 79. Alim ARMA, Faruque SM, Ahmad QS, Hossain KMB, Mahalanabis D, Albert MJ. Evaluation of a non-radioactive chemiluminescent method for using oligonucleotide and polynucleotide probes to identify enterotoxigenic Escherichia coli. J. Diarrhoeal Dis. Res. 1994; 12:113-116. 80. Qadri F, Haque A, Faruque SM, Bettelheim KA, Robins-Browne R, Albert MJ. Hemagglutination properties of Enteroaggregative Escherichia coli. J. Clin. Microbiol. 1994; 32:510-514. 81. Albert MJ, Siddique AK, Islam MS, Faruque ASG, Ansaruzzaman M, Faruque SM, Sack RB. Large outbreak of clinical cholera due to Vibrio cholerae non-01 in Bangladesh. Lancet 1993; 341:704. 82. Albert MJ, Ansaruzzaman M, Bardhan PK, Faruque ASG, Faruque SM, Islam MS, Mahalanabis D, Sack RB, Salam MA, Siddique AK, Yunus M, Zaman K. Large epidemic of cholera-like disease in Bangladesh caused by Vibrio cholerae O139 synonym Bengal. Lancet 1993; 342:387-390. 83. Qadri F, Azim T, Hossain A, Islam D, Mondal G, Faruque SM, Albert MJ. A monoclonal antibody to Shigella dysenteriae serotype 13 cross-reacting with Shiga toxin. FEMS Microbiol. Lett. 1993; 107:343-348. 84. Albert MJ, Ansaruzzaman M, Qadri F, Hossain A, Kibriya AKMG, Haider K, Nahar S, Faruque SM, Alam AN. Characterization of Plesiomonas shigelloides strains that share type-specific antigen with Shigella flexneri 6 and common group 1 antigen with Shigella flexneri spp. and Shigella dysenteriae 1. J. Med. Microbiol 1993; 39: 211-217. 85. Haider K, Faruque SM, Albert MJ, Nahar S, Neogi PKB, Hossain A. Comparison of a modified adherence assay with existing assay methods for identification of enteroaggregative Escherichia cli. J. Clin. Microbiol. 1992; 30:1614-1616. 86. Albert MJ, Faruque SM, Ansaruzzaman M, Islam MM, Haider K, Alam K, Kabir I, Robins-Browne R. Sharing of virulence associated properties at the phenotypic and genetic levels between enteropathogenic Escherichia coli and Hafnia alvei. J. Med. Microbiol. 1992; 37:310-314. 87. Strockbine NA, Faruque SM, Kay BA, Haider K, Alam AN, Tzipori S and Wachsmuth K. DNA probe analysis of diarrhoeagenic Escherichia coli: detection of EAF-positive isolates of traditional enteropathogenic Escherichia coli serotypes among Bangladeshi paediatric diarrheal patients. Mol. Cell. Prob. 1992; 6:93-99. 88. Haider K, Faruque SM, Nahar S, Alam AN, Albert MJ, Tzipori S. Enteroaggregative Escherichia coli infections in Bangladeshi diarrhoeal children: clinical and microbiological features. J. Diarrhoeal Dis. Res. 1991; 9:318-322. 89. Albert MJ, Ansaruzzaman M, Faruque SM, Neogi PKB, Haider K, Tzipori S. An enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA) for the detection of localized adherent enteropathogenic Escherichia coli (EPEC). J. Infect. Dis. 1991; 164:986-989. 90. Albert MJ, Ansaruzzaman M, Faruque SM, Haider K, Qadri F, Islam MM, Kibriya AKMG, Tzipori S. An out break of keratoconjunctivitis due to Salmonella weltevreden in a guinea pig colony. J. Clin. Microbiol. 1991; 29:2002-2006. 91. Albert MJ, Alam K, Ansaruzzaman M, Montanaro J, Islam M, Faruque SM, Haider K, Bettelheim KA, Tzipori S. Localized adherence and attaching-effacing properties of non-enteropathogenic serotypes of Escherichia coli. Infect. Immun 1991; 59:1864-1868. 92. Faruque SM, Kabir Y, Bashar SAMK. Effect of vitamin A supplementation on the serum levels of some immunoglobulins in vitamin A deficient children. Peadiat. Indonesiana 1984; 24:249-253. 93. Faruque SM, Sharmeen L, Bashar SAMK. Study of some immune responses in postnatally malnourished rats. J. Pak. Med. Assoc. 1984; 34:270-271. 94. Faruque SM, Bashar SAMK. Effect of vitamin A deficiency on plaque forming response of antibody producing spleen cells against Salmonella typhimurium in rats. Bangladesh Med. Res. Coun. Bull. 1983; 2:37-42. Reviews and Book Chapters 95. Faruque SM, Nair GB, Mekalanos JJ. Genetics of stress adaptation and virulence in toxigenic Vibrio cholerae. DNA Cell Biol. 11:723-41. 2004. 96. Faruque SM, Mekalanos JJ. Pathogenicity islands and phages in Vibrio cholerae evolution. Trends. Microbiology. 2003; 11:505-510. 97. Faruque SM, Sack DA, Colwell RR, Sack RB, Nair GB, Emergence and Evolution of Vibrio cholerae O139. Proc. Natl. Acad. Sci, USA (PNAS). 2003;100:1304-1309. 98. Faruque SM, Nair GB. Molecular Ecology of toxigenic Vibrio cholerae. Microbiol. Immunol. 2002; 46:59-66 99. Faruque SM, Albert MJ, Mekalanos JJ. Epidemiology, genetics and Ecology of Toxigenic Vibrio cholerae (Review). Microbiol. Mol. Biol. Rev. 1998; 62:1301-1314. 100. Colwell, R, Faruque, SM, and Nair GB. 2004. Free-living to Free-wheeling: the evolution of Vibrio cholerae from innocence to infamy. In Dronamraju KR ed. Infectious Disease and Host-Pathogen Evolution. Cambridge University Press, Cambridge. 101. Nair, GB, Faruque, SM, Garg, P, Ramamurthy, T, Takeda, Y. 2004. Molecular Epidemiology of Vibrio cholerae: Masquerade of a deceptive pathogen. In Furukawa et. al. eds. Ecological Destruction, Health, and Development. Kyoto University Press, Kyoto. 102. Faruque, SM, and Nair, GB. 2006. Epidemiology. In F. L. Thompson ed., The Biology of Vibrios. ASM press. Washington D.C. 103. Yamasaki, S., Asakura, M., Tsukamoto, T., Deb, R., Ramamurthy, T. and Faruque SM. 2006. Cytolethal distending toxin (CDT): Genetic diversity, structure, and role in diarrheal disease. Toxin Rev. 25:1-26. 104. Nair, GB., Faruque, SM, and Sack, DA. 2006. Vibrios. In Motarjemi Y, amd Adams, M. eds. Emerging Food borne Pathogens. Woodhead Publishing Ltd., Cambridge. 105. Faruque SM, and Mekalanos JJ. 2007. The Evolution of Vibrio cholerae and cholera epidemics. In F. Baquero, C. Nombela, G. H. Cassell and J. A. Gutiérrez eds., Introduction to Evolutionary Biology of Bacterial and Fungal Pathogens. ASM Press. Washington D.C. BOOK Vibrio cholerae: Genomics and Molecular Biology, Editors: Faruque SM, Nair GB. 2008. Horizon Scientific Press, Ltd. UK  ।