জীবন যেখানে দ্রোহের প্রতিশব্দ মৃত্যুই সেখানে শেষ কথা নয়। ঢাকা বিশ্ববিদ্যালয় প্রথম যে তিনটি হল নিয়ে যাত্রা শুরু করে জগন্নাথ হল তার একটি। ঢাকার বলিয়াদির জমিদার কিশোরীলাল চৌধুরীর পিতা জগন্নাথরায় চৌধুরীর নামে এই হলের নামকরন করা হয়। এই হলের প্রথম প্রোভোস্ট অধ্যাপক নরেশচন্দ্র সেনগুপ্ত। বিভিন্ন সময় বিখ্যাত অধ্যাপক সত্যেন্দ্রনাথ বোস, অধ্যাপক জ্ঞান চন্দ্র ঘোষ , ড. গোবিন্দচন্দ্র দেব, অধ্যাপক জ্যোতির্ময় গুহ ঠাকুরতা এই হলের প্রোভোস্ট হিসেবে দায়িত্ব পালন করেন।

মুক্তিযুদ্ধের সময় ড. গোবিন্দচন্দ্র দেব ও অধ্যাপক জ্যোতির্ময় গুহঠাকুরতা কে পাকিস্তানী সেনাবাহিনী হত্যা করে। ১৯৭১ খ্রীস্টাব্দের ২৫ মার্চ মধ্যরাতের পর পাকিস্তানের সেনাবাহিনী ঢাকাঢাকায় গণহত্যা অভিযান শুরু করে। এর অন্যতম লক্ষ্য ছিল ঢাকা বিশ্বাবিদ্যালয় এলাকা। এই অভিযান থেকে জগন্নাথ হল বাদ পড়েনি। ঐ রাতে জগন্নাথ হলের বহু আবাসিক ছাত্র ও কর্মচারী নিহত হয়।

১৯৮৫ খ্রীস্টাব্দের ১৫ অক্টোবর প্রাচীন জগন্নাথ হলের একটি আবাসিক ভবনের ছাদ ধ্বসে পড়লে সংঘটিত হয় মর্মান্তিক দুর্ঘটনা। এতে প্রাণ হারায় ৩৯ জন ছাত্র, কর্মচারী ও অতিথি। এরপর থেকেই দিনটি ঢাকা বিশ্ববিদ্যালয় শোক দিবস হিসেবে পালন করে আসছে। এই হলে রয়েছে মোট চারটি ভবন। ভবনগুলো হচ্ছে- গোবিন্দচন্দ্র দেব ভবন, সন্তোষচন্দ্র ভট্টাচার্য ভবন, অক্টোবর স্মৃতি ভবন এবং জোতির্ময় গুহঠাকুরতা ভবন।

আরো একটি ভবন এখন নির্মানাধীন রয়েছে। ।